24/02-2020 - Romuald Parmentier : Métabolisme, chromatine, transcription : qui régule qui ?

20 - Février - 2020

LES LUNDIS DE SAINT-ANTOINE

Bâtiment Kourilsky - 13h–14h

Salle des Conférences (Rez de Chaussée),

184 rue du Faubourg Saint-Antoine, Paris

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LUNDI 24 FEVRIER 2020

Métabolisme, chromatine, transcription : qui régule qui ?

Romuald Parmentier

Doctorant EPHE, 3ème année

Equipe F. Delhommeau (françois.delhommeau@inserm.fr)

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Originellement considéré pour sa fonction de production d’énergie au sein de la cellule, l’étude du métabolisme s’est étendue au domaine de la régulation épigénétique au cours de ces dernières années. De part le rôle essentiel que jouent certains métabolites dans de nombreux processus impliquant la chromatine, il est devenu légitime de réexaminer le rôle du réseau métabolique au niveau de la différenciation cellulaire. Plutôt que de l’envisager comme la résultante de l’expression génique, il s’agit au contraire d’interroger son éventuelle participation active aux changements d’expression observés au cours de la différenciation. A travers l’étude des premières étapes de l’hématopoïèse, les travaux présentés ici s’intéressent à l’articulation métabolisme – chromatine – transcription et tentent de déduire la dynamique d’interaction de ces trois aspects du fonctionnement cellulaire. Pour répondre à cette problématique, plusieurs cinétiques d’analyses (96h de culture maximum) sur des cellules CD34+ purifiées à partir de sang de cordon ombilical ont été confrontées. En particulier, la comparaison de profils d’accessibilité de l’ADN (ATACseq) avec des profils d’expression en cellule unique (Single-Cell RNAseq) a permis de mieux caractériser la régulation qui résulte du « dialogue » entre ces deux composantes. De même, l’utilisation d’autres techniques in vitro telles que la microscopie Time-Lapse et la cytométrie en flux permettent d’entrevoir les premiers liens entre le métabolisme et le phénotype des cellules.

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Saint-Antoine
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